ประกวดราคาจ้างวิเคราะห์หาลำดับเอ็กโซมและเมตาจีโนมทั้งหมด ในกลุ่มผู้ป่วยโรคเบาหวาน จำนวน 1 งาน
โครงการประกวดราคาจ้างวิเคราะห์หาลำดับเอ็กโซมและเมตาจีโนมทั้งหมดในกลุ่มผู้ป่วยโรคเบาหวานนี้ มีวัตถุประสงค์เพื่อสนับสนุนการพัฒนาแพลตฟอร์มการแพทย์แม่นยำแบบบูรณาการสำหรับการป้องกัน วินิจฉัย และรักษาโรคเบาหวานให้มีประสิทธิภาพสูงขึ้น โครงการนี้ใช้งบประมาณ 3,000,000 บาท โดยผู้เสนอราคาต้องเป็นนิติบุคคล มีคุณสมบัติครบถ้วนตามกฎหมาย, ไม่เป็นบุคคลล้มละลาย, ไม่อยู่ระหว่างเลิกกิจการ, ไม่เป็นผู้ถูกระงับการยื่นข้อเสนอ, และต้องมีคุณสมบัติอื่นๆ ตามที่กำหนดในเอกสารประกวดราคา ผู้ให้บริการจะต้องมีความสามารถในการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมและการตรวจวิเคราะห์โดยแพทย์เฉพาะทางด้านพันธุศาสตร์ มีระบบคุณภาพตามมาตรฐาน และใช้เทคโนโลยีที่ทันสมัยในการถอดรหัสพันธุกรรม ผลิตภัณฑ์ที่ส่งมอบคือข้อมูลในรูปแบบไฟล์ FASTQ พร้อมทั้งมีเงื่อนไขการส่งมอบและระยะเวลาดำเนินการที่ชัดเจน
English summary
This project is a procurement for the analysis of exome and metagenome sequences in a group of diabetic patients. The objective is to support the development of integrated precision medicine. The budget is 3,000,000 baht. Bidders must be juristic persons with specified qualifications and deliver the work within 120 days after signing the contract. Data will be delivered in FASTQ file format, and service providers must meet relevant standard qualifications.
ข้อมูลเชิงลึกของโครงการ
AI วิเคราะห์ ปลดล็อกแล้วเป้าหมายโครงการ
- เพื่อสร้างแพลตฟอร์มการแพทย์แม่นยำแบบบูรณาการในการนำเทคโนโลยีและนวัตกรรม ร่วมกับการประยุกต์ใช้ระบบการแพทย์ทางไกลและปัญญาประดิษฐ์ เพื่อการป้องกัน วินิจฉัย และรักษาโรคเบาหวานที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้น
- เพื่อพัฒนาเทคโนโลยีการป้องกัน วินิจฉัย และรักษาโรคเบาหวาน ที่ทันสมัยและมีประสิทธิภาพสูงขึ้น
- เพื่อเก็บรวบรวมข้อมูลการป้องกันและรักษาโรคเบาหวานของผู้ป่วย และสร้างฐานข้อมูลที่สามารถใช้ในการพัฒนาการแพทย์แม่นยำของโรคเบาหวานต่อไปได้
- เพื่อผลักดันเทคโนโลยีและนวัตกรรมทางการแพทย์ที่พัฒนาในประเทศ ให้มีมาตรฐาน และเป็นที่ยอมรับใช้งานได้จริง
- เพื่อการต่อยอดแพลตฟอร์มการแพทย์แม่นยำแบบบูรณาการนี้ ในการรักษาโรคอื่นๆต่อไป
ขอบเขตของงาน
- ดำเนินการและให้คำปรึกษาทางพันธุกรรมและการตรวจวิเคราะห์โดยแพทย์เฉพาะทางด้านพันธุศาสตร์ที่มีประสบการณ์และได้รับการรับรอง
- มีระบบคุณภาพที่ประกันคุณภาพการทดสอบ External Quality Assurance (EQA) ในรายการทดสอบที่เกี่ยวข้องกับการตรวจวิเคราะห์ด้วยเทคโนโลยี Next Generation Sequencing (NGS)
- ใช้เทคโนโลยีการถอดรหัสพันธุกรรม (Whole Exome Sequencing) หลักการ Combinatorial Probe-Anchor Synthesis (cPAS) and improved DNA Nanoballs (DNB) Technology
- ใช้วิธีถอดรหัสพันธุกรรมแบบ paired-end ที่มีความยาวของการถอดรหัสพันธุกรรมไม่น้อยกว่า 100 คู่เบส
- ถอดรหัสพันธุกรรมจากตัวอย่างดีเอ็นเอมนุษย์ ที่ความเข้มข้นไม่น้อยกว่า 20 นาโนกรัมต่อไมโครลิตร ปริมาณไม่น้อยกว่า 20 ไมโครลิตร
- มีขั้นตอนการควบคุมคุณภาพตัวอย่างดีเอ็นเอโดยการหาความเข้มข้นและปริมาณของตัวอย่างดีเอ็นเอ และมีการตรวจสอบความสมบูรณ์ (Integrity) ของตัวอย่าง
- มีขั้นตอนการควบคุมคุณภาพของ DNA Library ด้วยการวัดปริมาณของ Library และการวัดขนาดโดยวิธี Fragment analysis
- Whole Exome Sequencing: Average coverage 100X, Percentage of bases with Q20 (Phred score) ไม่น้อยกว่าร้อยละ 90, Percentage of bases with Q30 (Phred score) ไม่น้อยกว่าร้อยละ 80
- Whole metagenome sequencing: Total reads ไม่น้อยกว่า 10 Gb, Percentage of bases with Q20 (Phred score) ไม่น้อยกว่าร้อยละ 90, Percentage of bases with Q30 (Phred score) ไม่น้อยกว่าร้อยละ 80
- ส่งมอบข้อมูลรหัสพันธุกรรมในรูปแบบไฟล์ FASTQ ที่ได้จากเครื่องถอดรหัสพันธุกรรม โดยมีการบีบอัดเพื่อลดขนาดไฟล์
สิ่งที่ต้องส่งมอบ
- ข้อมูลรหัสพันธุกรรมในรูปแบบไฟล์ FASTQ ที่ได้จากเครื่องถอดรหัสพันธุกรรม
- ไฟล์ข้อมูลที่ถูกบีบอัด (zip file)
- ข้อมูลบันทึกอยู่ใน external hard drive
ระยะเวลาดำเนินการ
- ระยะเวลาส่งมอบ 120 วัน นับถัดจากวันลงนามในสัญญา
- ระยะเวลาดำเนินการทดสอบ 60 วันหลังจากตัวอย่างได้รับการตรวจสอบคุณภาพเรียบร้อยแล้ว
- ผู้ให้บริการจะดำเนินการสำรองข้อมูลการถอดรหัสพันธุกรรมหลังส่งมอบงานไว้เป็นระยะเวลา 90 วัน
คุณสมบัติผู้เสนอราคา
- Eligibility Requirements:
- มีความสามารถตามกฎหมาย
- ไม่เป็นบุคคลล้มละลาย
- ไม่อยู่ระหว่างเลิกกิจการ
- ไม่เป็นบุคคลซึ่งอยู่ระหว่างถูกระงับการยื่นข้อเสนอหรือทำสัญญากับหน่วยงานของรัฐ
- ไม่เป็นบุคคลซึ่งถูกระบุชื่อไว้ในบัญชีรายชื่อผู้ทิ้งงาน
- มีคุณสมบัติและไม่มีลักษณะต้องห้ามตามที่คณะกรรมการนโยบายฯ กำหนด
- เป็นนิติบุคคล ผู้มีอาชีพรับจ้างงานที่ประกวดราคาอิเล็กทรอนิกส์
- ไม่เป็นผู้มีผลประโยชน์ร่วมกันกับผู้ยื่นข้อเสนอรายอื่น
- ไม่เป็นผู้ได้รับเอกสิทธิ์หรือความคุ้มกันซึ่งอาจปฏิเสธไม่ยอมขึ้นศาลไทย
- ต้องลงทะเบียนในระบบ e-GP
- Standards Compliance:
- มีระบบคุณภาพที่ประกันคุณภาพการทดสอบ External Quality Assurance (EQA) ในรายการทดสอบที่เกี่ยวข้องกับการตรวจวิเคราะห์ด้วยเทคโนโลยี Next Generation Sequencing (NGS)
- ได้รับการรับรองความสามารถห้องปฏิบัติการตามมาตรฐาน ISO 15189:2012, ISO 15190:2003 ในรายการทดสอบที่เกี่ยวข้องกับการตรวจวิเคราะห์จีโนมด้วยเทคโนโลยี Next Generation Sequencing (NGS)
- Experience:
- มีประสบการณ์ในการตรวจวิเคราะห์ทางพันธุกรรมและเวชศาสตร์จีโนมทางการแพทย์ให้กับคนไทยมาไม่น้อยกว่า 3 ปี
- Previous Project Cost: -
- Technical Capabilities:
- ใช้เทคโนโลยีการถอดรหัสพันธุกรรม (Whole Exome Sequencing) หลักการ Combinatorial Probe-Anchor Synthesis (cPAS) and improved DNA Nanoballs (DNB) Technology
- ใช้วิธีถอดรหัสพันธุกรรมแบบ paired-end ที่มีความยาวของการถอดรหัสพันธุกรรมไม่น้อยกว่า 100 คู่เบส
- สามารถถอดรหัสพันธุกรรมจากตัวอย่างดีเอ็นเอมนุษย์ ที่ความเข้มข้นไม่น้อยกว่า 20 นาโนกรัมต่อไมโครลิตร ปริมาณไม่น้อยกว่า 20 ไมโครลิตร
- Personnel:
- ดำเนินการและให้คำปรึกษาทางพันธุกรรมและการตรวจวิเคราะห์โดยแพทย์เฉพาะทางด้านพันธุศาสตร์ที่มีประสบการณ์และได้รับการรับรอง
- Financial Requirements:
- กรณีผู้ยื่นข้อเสนอเป็นนิติบุคคลที่จัดตั้งขึ้นตามกฎหมายไทยซึ่งได้จดทะเบียนเกินกว่า 1 ปี ต้องมีมูลค่าสุทธิของกิจการ จากผลต่างระหว่างสินทรัพย์สุทธิหักด้วยหนี้สินสุทธิ ที่ปรากฏในงบแสดงฐานะการเงินที่มีการตรวจรับรองแล้ว ซึ่งจะต้องแสดงค่าเป็นบวกติดต่อกันเป็นระยะเวลา 1 ปีสุดท้ายก่อนวันยื่นข้อเสนอ
- กรณีผู้ยื่นข้อเสนอเป็นนิติบุคคลที่จัดตั้งขึ้นตามกฎหมายไทย ซึ่งยังไม่มีการรายงานงบแสดงฐานะการเงินกับกรมพัฒนาธุรกิจการค้า ให้พิจารณาการกำหนดมูลค่าของทุนจดทะเบียน โดยผู้ยื่นข้อเสนอจะต้องมีทุนจดทะเบียนที่เรียกชำระมูลค่าหุ้นแล้ว ณ วันที่ยื่นข้อเสนอ ไม่ต่ำกว่า 1 ล้านบาท
- กรณีผู้ยื่นข้อเสนอเป็นบุคคลธรรมดา ต้องมีมูลค่าสุทธิของกิจการ โดยพิจารณาจากบัญชีเงินฝากธนาคาร ณ วันยื่นข้อเสนอ โดยต้องมีเงินฝากเป็นบวกในมูลค่า 1 ใน 4 ของมูลค่างบประมาณที่ยื่นข้อเสนอในครั้งนั้น
- กรณีที่ผู้ยื่นข้อเสนอไม่มีมูลค่าสุทธิของกิจการและทุนจดทะเบียน หรือมีแต่ไม่เพียงพอที่จะเข้ายื่นข้อเสนอ ผู้ยื่นข้อเสนอสามารถขอวงเงินสินเชื่อเพื่อมาสนับสนุนให้มูลค่าสุทธิ ของกิจการ (Net Worth) ไม่ติดลบ หรือให้มีสภาพคล่องที่ดีจนเพียงพอต่อการยื่นข้อเสนอ โดยต้องมีวงเงินสินเชื่อ 1 ใน 4 ของมูลค่างบประมาณที่ยื่นข้อเสนอในครั้งนั้น
เกณฑ์การพิจารณา
- การพิจารณาคัดเลือกผู้ชนะการยื่นข้อเสนอ จะพิจารณาตัดสินโดยใช้หลักเกณฑ์ราคา
ข้อกำหนดทางเทคนิค
- Whole Exome Sequencing:
- Average coverage 100X
- Percentage of bases with Q20 (Phred score) ไม่น้อยกว่าร้อยละ 90
- Percentage of bases with Q30 (Phred score) ไม่น้อยกว่าร้อยละ 80
- Whole metagenome sequencing:
- Total reads ไม่น้อยกว่า 10 Gb
- Percentage of bases with Q20 (Phred score) ไม่น้อยกว่าร้อยละ 90
- Percentage of bases with Q30 (Phred score) ไม่น้อยกว่าร้อยละ 80
เงื่อนไขสัญญา
- คณะวิศวกรรมศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย จะจ่ายค่าจ้างเมื่อผู้ขายส่งมอบสิ่งของครบถ้วนและมีการตรวจรับมอบเรียบร้อยแล้ว
- อัตราค่าปรับ:
- ร้อยละ 0.10 ของราคาค่าจ้างต่อวัน
- ร้อยละ 10 ของวงเงินของงานจ้างช่วง กรณีมีการนำงานไปจ้างช่วงโดยไม่ได้รับอนุญาต
คำถามที่พบบ่อย (FAQ)
- การวิเคราะห์ข้อมูลทางพันธุกรรมจะดำเนินการอย่างไร?
- การวิเคราะห์จะใช้เทคโนโลยีขั้นสูง เช่น Whole Exome Sequencing และ Whole metagenome sequencing ตามข้อกำหนดที่ระบุ
- ข้อมูลที่ส่งมอบจะมีรูปแบบใด?
- ข้อมูลจะถูกส่งมอบในรูปแบบไฟล์ FASTQ ซึ่งเป็นรูปแบบมาตรฐานสำหรับการจัดเก็บข้อมูลลำดับเบส
- ระยะเวลาในการดำเนินการวิเคราะห์ข้อมูลทั้งหมด?
- ระยะเวลาดำเนินการทดสอบอยู่ที่ 60 วันหลังจากตัวอย่างได้รับการตรวจสอบคุณภาพเรียบร้อยแล้ว
- ต้องส่งมอบเอกสารอะไรบ้างในวันยื่นข้อเสนอ?
- เอกสารแสดงห้องปฏิบัติการทางเทคนิคการแพทย์, เอกสารรับรองมาตรฐานการบริการเวชศาสตร์จีโนม, และเอกสารรับรองมาตรฐาน ISO 15189:2012, ISO 15190:2003
- มีการรับประกันคุณภาพของข้อมูลอย่างไร?
- มีการควบคุมคุณภาพในหลายขั้นตอน รวมถึงการวัดค่า coverage, Q20, Q30 และการตรวจสอบคุณภาพของ DNA library
- หากต้องการสอบถามข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับโครงการ จะติดต่อได้ที่ไหน?
- (- ข้อมูลไม่ได้ระบุไว้ใน TOR-)